Bignona, bourgade de Casamance, se trouve à 80 km de l’océan Atlantique, entre la frontière gambienne et le fleuve Casamance, à une trentaine de kilomètres au nord de Ziguinchor.

Chef-lieu du département de Bignona, une subdivision de la région de Ziguinchor, la ville de Bignona est un carrefour de 27  070 habitants (2007) sur la N4 et la N5.
Elle est reliée par la route à Dakar et à Ziguinchor.
Comme toute la région, la ville a une altitude assez faible (33 mètres environ).
Les communes les plus proches sont Koutenghor, Bindago, Boutolatte, Djikesse, Djiwa, Takème, Mangoule, Tenghory, Colomba et Guérina.
Le climat à Bignona est tropical avec une température moyenne annuelle de 26,5 °C et des précipitations d’environ 1 123 mm par an, plus importantes en été qu’en hiver.